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基因专利信息相关的微生物基因组注释平台

更新时间:2015.04.11

【项目名称】:基因专利信息相关的微生物基因组注释平台
【项目编号】:30800640
【立项时间】:2008年
【项目类型】:国家自然科学基金青年科学基金项目
【项目性质】:青年科学基金项目
【负 责 人】:刘翟
【工作单位】:中国科学院微生物研究所
【完成时间】:2011年12月31日

项目成果

【项目摘要】


随着生物学和生物产业的发展,基因相关的专利数据也越来越多的被重视和使用。据欧洲专利局发布的数据,目前有逾58万条与微生物相关的DNA序列被进行了专利保护。如何合理有效的将专利数据与现如今的基因组数据进行关联是一个需要解决的现实问题,而目前国际上也缺少这一交叉领域的研究。本项目整合了微生物基因组信息、基因专利信息,利用数据库层-应用层-数据展示层三层结构建立了基于专利信息的微生物基因组注释系统(http://genome.im.ac.cn),将海量的微生物基因、基因组数据与相关专利信息相互联系,通过基因组的检索能够最终连接到专利的摘要信息。目前,该系统已经应用于基于专利信息的数据挖掘和微生物基因组注释相关的工作。与此同时,本项目的技术平台还用于了诸如生命条形码信息系统、禽流感信息系统的开发和应用。在整个项目执行过程中,建设数据平台4个;参与发表SCI论文8篇;参与编写著作章节1篇;进行国际会议报告5次;培养硕士研究生3名;出站博士后1名。